есть такой плагин
https://umod.org/plugins/craft-ui
в его описании дано объяснение, почему нельзя убрать стоковые компоненты при крафте - они вшиты в клиентскую часть (с выводом в меню крафта), поэтому этот плагин через gui имитирует крафт через свой интерфейс также как и
этот, и потому плагины, которые не гивают предметы сами вроде antiitems просто подставляют компоненты в инвентарь, т.к. в этом случае крафт происходит через интерфейс игры, видимо по-другому нельзя..
не знаю работает ли этот плагин еще, там написано, что он заброшен/переписывается, но суть думаю понятна
(возможно я что-то не так понял, поправите, за неимением других вариантов это мб выход)